Podatkovna infrastruktura Srca pomaže u novim slikovnim metodama dijagnostike staničnog odbacivanja srčanog presatka

Istraživačka skupina Medicinskog fakulteta Sveučilišta u Zagrebu, predvođena izv. prof. dr. sc. Majom Čikeš, provodi projekt Hrvatske zaklade za znanost GRAFT-XPCI – Nova paradigma utvrđivanja odbacivanja presatka srca: dijagnostika fazno-kontrastnim oslikavanjem X-zrakama proizvedenim sinkrotronom. Cilj projekta je razviti inovativnu i neinvazivnu slikovnu metodu koja bi mogla unaprijediti dijagnostiku staničnog odbacivanja srčanog presatka.

Tradicionalna dijagnostika temeljena na invazivnim biopsijama i dvodimenzijskim prikazima ima svoja ograničenja. Nova metoda, fazno-kontrastno oslikavanje X-zrakama (X-PCI), omogućava trodimenzijsko prikazivanje uzoraka tkiva visoke rezolucije, bez potrebe za destruktivnom obradom. Snimanja se provode pomoću sinkrotrona na radnoj stanici TOMCAT u sklopu Swiss Light Source Instituta Paul Scherrer (PSI) u Švicarskoj.

Projekt je izrazito interdisciplinaran te okuplja stručnjake iz područja kliničke medicine, biomedicinskog inženjerstva i fizike iz Hrvatske, Španjolske i Švicarske. U analizi podataka koriste se napredne metode strojnog učenja s ciljem razvoja alata za automatsku interpretaciju dobivenih slika.

​U sklopu projekta prikuplja se iznimno velika količina digitalnih slikovnih podataka – i do 10 800 slika po uzorku, ukupne veličine do 155 GB, a ukupna količina podataka tijekom trajanja projekta dostiže gotovo 100 TB. Upravo zato, ključan dio podrške osigurava Srce kroz uslugu Pohrana i upravljanje podacima - Puh.

​Puh se koristi za pouzdano čuvanje podataka u oblaku, prijenos i udaljeni pristup velikim slikovnim datasetima s više različitih lokacija. Omogućava siguran, šifriran i vremenski neovisan pristup podacima svim istraživačima uključenima u projekt, uključujući inozemne partnere.

„Zahvaljujući usluzi Puh, riješili smo izazov pohrane i upravljanja velikim količinama osjetljivih istraživačkih podataka. Srce nam je omogućilo jednostavno, stabilno i sigurno rješenje za pohranu, analizu i razmjenu podataka, što je ključna podrška uspjehu našeg projekta“, ističe izv. prof. dr. sc. Maja Čikeš.

Očekuje se da će rezultati projekta potvrditi vrijednost X-PCI metode i omogućiti njezinu širu primjenu u dijagnostici odbacivanja presatka te drugim područjima kardiologije, uz potencijalni utjecaj na unapređenje kliničke prakse transplantacijske medicine.

Cijeli tekst donosimo vam u 101. broju Srce novosti.